نزاعات دوليّة مع ناميبيا
تنظيم الحدود بين بتسوانا مع ناميبيا في كل من كواندو Kwando، ولينيانتي Linyanti، نهر شوبي Chobe River، متضمنة مستنقعات سيتونجو Situngu، تم حلها ودياً، في عام 2003.
هناك قلق من الخبراء الدوليين ومن السكان المحليين على حياة السكان في مثلث أوكافانجو Okavango في بتسوانا، من نزوح وطرد البشر، بسبب خطة ناميبيا لبناء سد هيدروليكياً في شلالات بوبا Popa Falls، التي تقع على طول الحدود بين أنجولا وناميبيا. فقد شيدت بتسوانا سدوداً كهربائية لتمنع آلاف الزيمبابويين الذين يرحلون لإيجاد عمل ويهربون من الاضطهاد السياسي.
وبالنسبة لناميبيا، فتدعم مشاريع السدود منذ أمد طويل. وفي عام 2004، أبدت زيمبابوي اعتراضاتها على خطط بين بتسوانا وزامبيا، لبناء جسر على نهر زامبيزي، فضلاً عن النزاع الدائر بين بتسوانا وزامبيا حول نقطة التقاء الحدود بينهما.