با تصمیم اخیر شورای عالی دانشگاه الازهر مبنی بر الحاق دهها هزار مرکز آموزشی و دانشکده های این دانشگاه به بخش آموزش عالی مصر، نگرانی ها درباره لغو تدریس علوم دینی در این مراکز شدت گرفت.
علی لبن، نماینده پارلمان از فراکسیون اخوان المسلمین مصر با هشدار درباره پیامد چنین تصمیمی گفت: این تصمیم غیر قانونی است و هدف از آن خدمت به آمریکا و اسراییل برای توقف تدریس علوم دینی در مصر است. به گزارش اخبار العالم این نماینده پارلمان افزود، چنین تصمیمی با هدف رفع نگرانیهای آمریکا و اسراییل است که پیش از این با هشدار درباره خطر دانشگاه الازهر از این دانشگاه به عنوان " خطر سبز" یاد کرده بودند. وی این تصمیم را در صلاحیت شورای عالی الازهر ندانست و ادامه داد، چنین تصمیمی باید در مجلس الشعب( پارلمان) اتخاذ می شد زیرا نتیجه این تصمیم منحصر کردن تدریس علوم دینی تنها در دانشکده های ده استان است. لبن حکومت مصر را در تصمیم اخیر شورای عالی الازهر سهیم دانست و گفت: چنین تصمیمی تنها درچارچوب طرح های شیطانی دولت مصر است و پیش از این نیز نمونه هایی از آن راشاهد بوده ایم. نماینده پارلمان مصر در ادامه، پیامد چنین تصمیمی بر نظام آموزشی الازهر را بسیار ناگوار خواند و از رییس پارلمان و رییس دانشگاه الازهر خواست در نشستی این مسئله را بررسی کنند. گفتنی است، بر اساس تصمیم اخیر شورای عالی الازهر، هشت هزار مرکز آموزشی و شصت و هشت دانشکده وابسته به دانشگاه الازهر به آموزش عالی مصر خواهند پیوست ضمن اینکه در ده دانشکده مستقر در ده استان، بخشی با عنوان بخش آموزش علوم دینی تاسیس می شود. واکنش منتقدان این تصمیم بدین سبب است که الازهر دو شعبه علمی و ادبی دارد که در هر دو شعبه علوم شرعی نیز یکی از مفاد درسی آن است اما تصمیم اخیر شورای عالی راه را برای حذف مواد درسی علوم شرعی از دانشکده ها و مراکز مختلف هموار می کند تا آموزش انی علوم تنها در ده دانشکده منحصر شود.