با نزدیک شدن به زمان برگزاری همه پرسی در جنوب سودان، دامنه اختلافات بین دولت مرکزی در شمال و مخالفان در جنوب این کشور شدت گرفت.
طارق عثمان، عضو کمیته همه پرسی جنوب سودان، در تازه ترین اظهارات درباره برگزاری همه پرسی، گفت: این همه پرسی یا باید لغو شود یا به علت فرصت اندکی که پیش رو داریم به تاخیر بیفتد. عثمان گفت "فرصت باقی مانده برای برگزاری همه پرسی کافی نیست زیرا ثبت نام حائزان شرایط رای باید نهایی شود و براساس قانون، سه ماه قبل از برگزاری انتخابات منتشر گردد؛ در صورتی که فرصت باقی برای حل این مسائل کافی نیست؛ در نتیجه لغو همه پرسی یا تاخیر حداکثر شش ماهه زمان برگزاری آن، دو گزینه پیش روی ماست. " در حال حاضر حزب کنگره ملی ( حزب حاکم) و جنبش آزادیبخش خلق( ناراضیان جنوب) درباره چگونگی تعیین مرز شمال و جنوب، چگونگی تقسیم ثروت و تلاش برای تعریف شهروندی اختلاف نظر دارند. در شرایطی که کنگره ملی خواستار تعیین مرز در قبل از برگزاری همه پرسی است، جنبش آزادیبخش، این خواسته را به منزله مشروط کردن همه پرسی و تلاش برای ایجاد چالش در مسیر اجرای مفاد توافقنامه صلح سال دو هزار و پنج می داند. یکی از نگرانی های کارشناسان این است که هر گونه تلاش برای تاخیر همه پرسی یا ایجاد مشکل در مسیر برگزاری آن ممکن است بار دیگر شعله های جنگی را در سودان روشن کند که پیش از این حدود دو میلیون قربانی گرفت و ثبات نواحی شرق آفریقا را به مخاطره افکند. به گزارش الرساله نت، همه پرسی جنوب سودان با هدف تعیین سرنوشت این منطقه (رسیدن به استقلال یا ادامه فعالیت تحت حاکمیت دولت مرکزی) از بندهای اساسی توافقنامه صلح شمال و جنوب در سال دوهزار و پنج است که قرار است در نهم ژانویه دو هزارو یازده انجام شود. با نزدیک شدن زمان برگزاری همه پرسی شواهد نشان می دهد اهالی جنوب به استقلال این منطقه رای خواهند داد؛ به همین منظور شورشیان جنوب موسوم به جنبش آزادیبخش خلق سودان با هر گونه تاخیر در برگزاری همه پرسی مخالفند.