برگزاری همه پرسی در باره استقلال جنوب سودان در ماه ژانویه، خطر ازسرگیری جنگ داخلی در این کشور را به همراه دارد جنگی که برای سودان ،کشورهای همسایه و جامعه بین المللی یکصد میلیون دلار هزینه خواهد داشت.

سازمان غیر دولتی اجیس تراست Aegis Trust , ، و سه مرکز پژوهشی دیگر در زمینه مطالعات امنیتی ، برای پس از همه پرسی سودان چهار وضعیت را پیش بینی کرده اند که از صلح تا بازگشت به یک جنگ داخلی گسترده بین شمال و جنوب سودان را شامل می شود. بر اساس این پیش بینی ها، در صورت وقوع جنگی با شدت متوسط و ده ساله، سودان دست کم پنجاه و دو میلیارد و یکصد میلیون دلار و اقتصاد کشورهای همسایه جنوبی ( اتیوپی، کنیا و اوگاندا)، حدود بیست و نه میلیارد دلار ضرر می کند .

در همین حال جامعه بین المللی نیز باید بیش از سی میلیارد دلار هزینه برای ماموریت های صلح و کمک های بشردوستانه هزینه کند. طبق بیانیه ای که ضمیمه این تحقیقات است ، هزینه جنگ احتمالی در سودان بالاست وبه همین علت تلاشهای بازیگران محلی، منطقه ای و بین المللی باید بر جلوگیری از وقوع جنگی متمرکز شود که احتمالا بیش از یکصد میلیارد دلار هزینه خواهد داشت و جان شمار زیادی را خواهد گرفت.

پیش بینی می شود در صورت بازگشت جنگ داخلی به سودان، تولید ناخالص داخلی این کشور سالانه بطور متوسط دو ممیز دو واحد کاهش می یابد. به گزارش خبرگزاری فرانسه از خارطوم ،ازسوی دیگر اتیوپی وکنیا که در مرزهای جنوبی سودان قرار دارند سالانه بیش از یک میلیارد دلار ضرر می کنند. چنین جنگی برای مصر هم که در مرزهای شمالی سودان قرار دارد و مهمترین اقتصاد منطقه به شمار می رود، تبعات منفی خواهد داشت. اما اگر شدت جنگ داخلی سودان، بیشتر باشد ، این ضررها بیشتر و تولید نفت هم در این کشور بزرگ افریقایی فلج می شود.